Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms