Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms