Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms