Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms