Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms