Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms