Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ift27Q9D0P8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ift27Q9D0P8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ift27Q9D0P8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ift27Q9D0P8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ift27Q9D0P8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ift27Q9D0P8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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