Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms