Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms