Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms