Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms