Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2Q9CUU3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms