Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms