Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms