Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl35Q9CQL6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl35Q9CQL6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl35Q9CQL6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl35Q9CQL6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl35Q9CQL6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl35Q9CQL6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl35Q9CQL6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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