Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nudt21Q9CQF3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms