Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms