Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CQC3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms