Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Use1Q9CQ56 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Use1Q9CQ56 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Use1Q9CQ56 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Use1Q9CQ56 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms