Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms