Protein–RNA interactions for Protein: Q99N94

Mrpl9, 39S ribosomal protein L9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl9Q99N94 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl9Q99N94 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl9Q99N94 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms