Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms