Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms