Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms