Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms