Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms