Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nmd3Q99L48 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nmd3Q99L48 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nmd3Q99L48 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nmd3Q99L48 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nmd3Q99L48 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nmd3Q99L48 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nmd3Q99L48 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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