Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms