Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TriobpQ99KW3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms