Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps4Q99KG7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms