Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms