Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1dQ99246 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms