Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spdl1Q923A2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms