Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms