Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms