Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfcdQ922L6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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NelfcdQ922L6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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NelfcdQ922L6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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NelfcdQ922L6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NelfcdQ922L6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms