Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms