Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms