Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms