Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms