Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snx15Q91WE1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snx15Q91WE1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snx15Q91WE1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snx15Q91WE1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx15Q91WE1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx15Q91WE1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx15Q91WE1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx15Q91WE1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx15Q91WE1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx15Q91WE1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx15Q91WE1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx15Q91WE1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx15Q91WE1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snx15Q91WE1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Snx15Q91WE1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx15Q91WE1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms