Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms