Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp25Q8VIK1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp25Q8VIK1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp25Q8VIK1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp25Q8VIK1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp25Q8VIK1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms