Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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