Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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