Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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