Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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