Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms