Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hecw1Q8K4P8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hecw1Q8K4P8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms