Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OptnQ8K3K8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms